Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms