Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms