Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCSAPQ6IQ19 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms