Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL3Q6DD88 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms