Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms