Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FRMPD3Q5JV73 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD3Q5JV73 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms