Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALFQ53S48 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms