Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms