Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms