Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms