Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms