Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRFIP1Q32MZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms