Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKIDA1Q1XH10 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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