Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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