Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms