Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CDO1Q16878 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CDO1Q16878 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CDO1Q16878 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CDO1Q16878 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CDO1Q16878 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CDO1Q16878 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDO1Q16878 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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