Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NDUFA9Q16795 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFA9Q16795 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms