Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIST3H3Q16695 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms