Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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