Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF56Q15929 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms