Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCAPHQ15003 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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