Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ODF1Q14990 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms