Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HNF4GQ14541 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms