Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNIQ14094 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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