Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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