Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE7AQ13946 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7AQ13946 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms