Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBA3CQ13748 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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