Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAPSNQ13702 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms