Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF5Q13568 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF5Q13568 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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