Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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C1orf61Q13536 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1orf61Q13536 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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