Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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