Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF3Q13114 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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