Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTP4A2Q12974 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PTP4A2Q12974 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTP4A2Q12974 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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