Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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