Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms