Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TROQ12816 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TROQ12816 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TROQ12816 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TROQ12816 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TROQ12816 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TROQ12816 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TROQ12816 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TROQ12816 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TROQ12816 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROQ12816 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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