Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGM3Q08188 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms