Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLEQ07864 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms