Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAX8Q06710 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms