Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms