Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARID5AQ03989 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARID5AQ03989 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms