Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms