Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSG1Q02413 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms