Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRG1Q02297 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRG1Q02297 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms