Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms