Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEX3Q00994 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BEX3Q00994 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms