Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1BQ00975 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms