Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYBPC1Q00872 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYBPC1Q00872 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms