Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms