Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGD1P98174 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGD1P98174 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms